O preço médio, calculado pelo sistema para cada ativo, segue o conceito utiluizado pela Receita para a apuração do imposto de renda. Ele é diferente do preço médio da operação, em que você obteria o valor pago mais a corretagem e taxas pagas, divididos pela quantidade de ações adiquiridas. No preço médio da posição, que é o utilizado pelo sistema, são levadas em consideração todas operações feitas com o mesmo ativo.
Caso você adquira 100 ações no preço de R$10,00, gastando R$50,00 de custos e posteriormente mais 500 à R$13,00, com também R$50,00 de custos, seu preço médio da posição será de 100 x (10+(50/100)) + 500 x (13+(50/500)), o que é igual a R$12,67. Quando uma venda for realizada, o IR será apurado com o preço da venda menos o preço médio da posição. Caso o preço médio utilizado fosse o de cada operação, na primeira você calcularia o valor de R$ 10,50 e na segunda R$ 13,10.
Note que, numa posição comprada, o preço médio só é alterado com novas compras. No momento da venda, o preço médio não é alterado, visto que o estoque do ativo é somente reduzido, sem alterar o preço dos ativos restantes no estoque. Já no caso de uma posição vendida, o preço médio só é alterado em novas vendas, sem que seja alterado no momento em que há uma compra.
A única exceção são operações day-trade. Elas tem um cálculo separado das operações normais, pois a tributação é diferente em cada caso.